制备DNA测序模板实验-小量裂解物中制备λ噬菌体DNA

1.  在新鲜配制的λ顶层琼脂糖和λ琼脂糖平板上,通过在平板上裂解适于λ噬菌体生长的大肠杆菌菌株,制备重组λ噬菌体毒种原液。

2.  取700 μl 毒种液加入无菌的1.5 ml 微量离心管中,加入1 μl 1 mg/ml 的DNA酶Ⅰ及1 μl 1 mg/ml 热处理过的RNA酶A,于37℃温育30 min。

3.  加入700 μl λPEG溶液,冰浴放置1 h。
 
4.  4℃高速离心10 min,弃上清。再于4℃高速离心2 min,用拉细了的巴斯德吸管吸去残余上清。
 
5.  重悬噬菌体沉淀于500 μl SM 培养液,加入55 μl 10%SDS,0.5 μl 0.5 mol/l EDTA,轻轻混匀,于65 ℃保温15 min,不时轻轻摇匀溶解所有沉淀物。

6.  加入缓冲液平衡酚,用旋涡混合器剧烈振荡来抽提。

7.  室温高速离心2 min 将上层水相移入一个干净微量离心管中,重复用500 μl 1:1酚/氯仿抽提,再重复用500 μl 氯仿抽提。
 
8.  加入50 μl 3 mol/l pH7.0乙酸钠缓冲液,随后加入550 μl 异丙醇,于-20℃冰冻30 min。
 
9.  于4 ℃高速离心15 min,吸出并弃上清,晾干DNA沉淀。

10.  重悬沉淀于50 μl pH8.0的TE缓冲液。
 
11.  用于测序时,在碱溶液中变性0.1~0.3 pmol DNA(2~4 μg)。
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