R2-02第八期ggplot画heatmap

真·科研狗 2017-12-26 19:52:43 阅读: 1329

library(reshape2)
library(scales)
library(plyr)
library(ggplot2)
data=read.csv("E:/2.csv",header = T)
head(data)

data1=melt(data,id.vars = c("ID"))
head(data1)

p=ddply(data1,
        .(variable),
        transform,
        label=rescale(value)
        )
Q=ggplot(p,
         aes(x=variable,y=ID)
         )+
  geom_tile(aes(fill=label))+
  scale_fill_gradient(low="#00ff22",high="#ff5252")+
  xlab("Groups")+
  ylab("ID")+
  labs(title="R2-02")
print(Q)

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