ACS Catalysis | 上海交大分子酶学研究团队开发非天然底物结合适配策略实现氨基转移酶高效进化

近日,国际知名期刊《ACS Catalysis》在线发表了上海交大冯雁教授团队崔莉副研究员的研究成果“Molecular Evolution of an Aminotransferase Based on Substrate–Enzyme Binding Energy Analysis for Efficient Valienamine Synthesis”。该研究提出了基于“酶-底物结合能分析”
2022-11-09

SCIENCE CHINA Life Sciences | 同济大学-微众银行刘琦教授团队开发首个隐私保护方式下大规模单细胞参考图谱构建和单细胞类型自动鉴定方法

单细胞转录组学在单个细胞水平上对转录组进行测序分析,对于理解细胞和组织的复杂机制不可或缺。近年来,随着单细胞测序技术的快速发展,单细胞测序技术实验通量大幅增加,可以对愈加复杂多样的样本进行分析,并随着时间的推移积累了大量的参考数据集。各种社区甚至产生了许多图谱级单细胞数据集,如人类细胞图谱[1],人类肿瘤图谱网络等[2]。这些数据有助于以有监督训练模型的方式自动进行细胞类型鉴定,而无需预先标记基
2022-11-04

EMBO report | 华中科技大学基础医学院刘蓉教授团队揭示抑郁症相关树突可塑性损伤新机制

10月28日,基础医学院病理生理学系刘蓉教授课题组在欧洲分子生物学组织旗下期刊EMBO reports在线发表了题为CIP2A deficiency promotes depression-like behaviors in mice through inhibition of dendritic arborization的最新研究成果,揭示了CIP2A蛋白功能缺陷在介导抑郁症相关突触可塑性损伤中
2022-11-05

Nature Communications | 上海交大白林泉团队解析新颖二聚化氨甲酰基转移酶晶体结构及催化机制

近日,上海交通大学生命科学技术学院白林泉教授团队在国际权威期刊《Nature Communications》上在线发表了题为“Endowing homodimeric carbamoyltransferase GdmN with iterative functions through structural characterization and mechanistic studies”的研究论文
2022-11-07

Nucleic Acids Research|同济大学王晨飞课题组合作建立肿瘤微环境单细胞转录组学数据库TISCH2

肿瘤的发生发展过程中,其所处的免疫微环境具有高度异质性,并和疾病的发展密切相关。单细胞转录组测序技术的出现,极大地提高了肿瘤微环境研究的分辨率,使得研究人员可以在单细胞层面探究肿瘤微环境中的细胞组成以及基因表达调控的异质性。肿瘤免疫疗法在控制肿瘤方面疗效显著,但临床试验表明,由于高度复杂的肿瘤微环境,免疫疗法仅对部分患者有效。因而,利用单细胞测序技术解析不同治疗条件和治疗响应情况下肿瘤样本的微环
2022-11-08

Nature Biotechnology | 北京大学伊成器和合作者开发m6A单碱基定量测序检测方法

2022年10月27日,北京大学生命科学学院伊成器课题组联合北大医学部药学院王晶课题组联合在Nature Biotechnology杂志上在线发表了题为“Absolute quantification of single-base m6A methylation in the mammalian transcriptome using GLORI”的研究成果。
2022-10-28

Chemical Society Reviews丨复旦大学鲁伯埙/丁澦/费义艳/邢栋合作发表以ATTEC等技术为代表的靶向溶酶体途径的降解新技术综述

鲁伯埙/丁澦/费义艳/邢栋合作发表以ATTEC等技术为代表的靶向溶酶体途径的降解新技术综述 本论文作为Chemical Society Reviews期刊2022年第21期封面论文发表 靶向溶酶体降解途径的主要技术汇总
2022-10-31

Stem Cell Reports | 同济大学陆建峰课题组建立TPH2-EGFP报告系统用于体外纯化和体内监测人类血清素神经元

血清素系统的异常变化与人类神经精神类疾病(抑郁症、精神分裂症、自闭症、慢性疼痛、婴儿猝死综合征等)的发生发展有关。科学家们在体外将人类多能干细胞分化为血清素神经元并开展了多项研究,为揭示上述疾病的发病机制并建立更好的治疗方法提供了重要途径。但是,体外定向分化获得血清素神经元的过程中,会产生大量的非血清素神经元细胞,这影响了分化体系的稳定性,不利于应用转录组学或蛋白质组学等了解人类血清素神经元的具
2022-11-03

Nucleic Acids Research | 复旦大学徐书华团队发布人类主要组织相容性复合体基因数据库和分析平台PGG.MHC

2022年11月2日,国际知名学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了复旦大学生命科学学院/人类表型组研究院徐书华教授团队开发的人类主要组织相容性复合体(MHC)基因数据库和计算分析平台PGG.MHC(https://www.pggmhc.org/pggmhc或https://pog.fudan.edu.cn/pggmhc),论文题为“PGG.MH
2022-11-03

Cell Reports Physical Science | 上海交大赵一雷团队基于人工智能证明生物合成酶预反应态分析的有效性

近日,Cell Press细胞出版社期刊《Cell Reports Physical Science》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院赵一雷教授研究团队题为“Understanding the effectiveness of enzyme pre-reaction state by quantum-based machine learning model”的最新成果。生命科学技术学院博士生
2022-11-03
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