脑科学研究院诸颖课题组开发空间转录组语义注释新算法Pianno

空间转录组学技术(如 10x Visium、Slide-seq 和 Stereo-seq)的最新进展彻底改变了对组织内基因表达模式的研究。然而,仅仅获得组织内特定物理坐标的基因表达谱不足以全面了解生物系统的复杂性。为了获得更深入的见解,必须辨别组织内每个空间点的生物学身份。 2024年4月2日,复旦大学脑科学研究院诸颖团队,在《自然通讯》(Nature Communications)上发表了题为《
2024-04-07

脑科学研究院黄芳课题组、肖雷课题组揭示焦亡介导分子GSDMD参与帕金森病中小胶质细胞激活和多巴胺能神经元死亡的新机制

帕金森病(Parkinson's disease,PD)是仅次于阿尔兹海默病的第二大神经退行性疾病,其主要病理特征为中脑黑质部位多巴胺能神经元的丢失,而神经元死亡的方式尚无定论。除了神经元的丢失,PD疾病进程中也伴随着神经炎症。细胞焦亡,作为一种炎性细胞程序性死亡方式,由Gasdermin家族介导并主要受炎性半胱天冬酶调控。GSDMD在PD疾病进程中发挥怎样的作用?与胶质细胞激活及神经元死亡之间存
2024-04-07

Plant Cell | 秦跟基课题通过构建拟南芥十二重突变体揭示雌蕊顶端命运决定的分子机制

被子植物的花是植物演化中的重要创新性状。花一般由萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊组成,其中雌蕊是最重要的雌性生殖器官。在长期演化过程中,雌蕊形成复杂的结构以顺利完成有性生殖过程。雌蕊顶端包括柱头和花柱,是接收花粉、促进花粉萌发和生长以完成双受精的关键门户,与农作物的产量密切相关。雌蕊顶端精细结构是如何形成的?到目前为止,对该科学问题的研究还相对较少。 2024年4月,北京大学生命科学学院秦
2024-04-07

Cell Prolif | 李程/孙育杰/黄粤课题组合作揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响

异倍体(aneuploidy),也被称为非整倍体,是指细胞中染色体数目的非整倍性变化,通常由细胞分裂过程中染色体的错误分配而引起。异倍体与一系列人类重大疾病相关,包括先天发育疾病,如21三体综合征(唐氏综合征),以及自发流产和死产等。此外,异倍体也是肿瘤细胞的重要特征之一,在约88%的人类癌症中可观察到异倍体的存在【1】。近年来的研究发现,异倍体对细胞的基因表达、增殖分化、适应性、基因组稳定
2024-04-06

Dev Cell | 高绍荣/江赐忠/高睿/陈嘉瑜揭示小鼠早期胚胎发育中以TFAP2C为核心的转录因子调控网络

哺乳动物的早期胚胎发育过程伴随细胞分化潜能的转变,具有全能性的合子在囊胚时期完成第一次细胞命运决定,形成内细胞团 (inner cell mass, ICM) 和滋养层 (trophectoderm, TE)。这一谱系分化过程受到染色质修饰和转录因子协同调控,随着微量表观组学技术的发展,已有非常多的研究揭示了表观遗传修饰在其中发挥的重要作用。相比之下,转录因子(transcription fac
2024-04-05

季维克团队发现VPS13家族蛋白SHIP164在早内吞体货物分选中的新功能和新机制

2024年4月2日,华中科技大学基础医学院/细胞架构研究中心季维克课题组和深圳湾实验室邓麟课题组合作在Cell Discovery(IF=33.5)在线发表了题为“RhoBTB3-SHIP164-Vps26B 复合体调控早内吞体出芽结构的生物发生”(Biogenesis Biogenesis of Rab14-positive endosome buds at Golgi–endosome
2024-04-03

生命学院李丕龙课题组开发基于相变设计的双特异性融合蛋白用于条件性肿瘤杀伤

作为一条新的细胞内关键组织原则,生物大分子相分离在各种生物过程和蛋白聚集疾病的发病机制中发挥着重要作用,因此也成为了生命科学领域的前沿热点之一。各国科学家开始以“相分离/相变”作为全新视角重新审视以往悬而未决的生物学问题。 在疾病领域,早期的基础研究主要集中在神经退行性疾病以及肿瘤细胞的异常增殖和免疫逃逸。同时,传统上被认为是“不可靶向”的药物靶点,如转录因子,生物分子凝聚体的发现为开发靶向药物
2024-04-02

基础医学院童雪梅团队揭示转酮醇酶调控线粒体代谢稳态的机制并提出治疗...

3月27日,基础医学院生化与分子细胞生物学系童雪梅教授课题组和刘俊岭教授课题组等合作在Cell Metabolism杂志在线发表题为Transketolase promotes MAFLD by limiting inosine-induced mitochondrial activity 的研究文章,揭示了高胰岛素血症促进肝脏转酮醇酶(transketolase, TKT)表达,通过改变核苷代谢
2024-04-02

基础医学院束敏峰团队揭示神经胶质瘤免疫逃逸新机制和免疫治疗新靶点

2024年3月28日,复旦大学基础医学院药理学系、教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室、上海市病原微生物与感染前沿科学研究基地束敏峰团队在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了题为“NSUN5/TET2-directed chromatin-associated RNA modification of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine
2024-04-01

生命学院颜宁、闫创业和潘俊敏团队合作首次揭示多聚糖介导生物复杂构造组装的分子机制

糖和脂类与蛋白、核酸一样都是构成生物结构、完成生理功能必不可缺的大分子,但是与后两者相比,糖与脂类的结构难以解析,属于细胞中的暗物质(Dark matter),糖生物学(Glycobiology)是生命科学业界公认的高难领域(图1)。糖对于生命至关重要:以葡萄糖为代表的糖类分子是细胞代谢主要的能量来源之一,植物中的细胞壁由纤维素构成,糖基化也是重要的翻译后修饰(Posttranslation
2024-03-29
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