Science, 2021-06-04, 复旦大学徐彦辉团队解析出人类转录预启动复合物(PIC)结构

后来 2021-07-14 14:07:27 阅读: 914

本期文章

1. 人介体和介体结合的预起始复合物的结构【徐彦辉@复旦大学】

2. 肽-MHC上的典型T细胞受体对接对于T细胞信号传导至关重要

3. 有义密码子重新分配使病毒抗性和编码聚合物合成

4. 使用无冲击压缩建立1 terapascal的金和铂标准

5. 相互排斥指示平行海马网络的精确组装

6. 强酸性条件下CO2电解制取多元碳产品

7. 具有快速自增强功能的坚韧水凝胶

8. 揭示GRB190829A余辉中x射线和伽马射线的时间和光谱相似性

9. 广泛的多效性和等位基因异质性介导IRX3和IRX5的代谢作用

10. 家庭COVID-19风险和面对面教育

11. 末次冰盛期间的南极地表温度和海拔高度

12. 抗体岩藻糖基化预测继发性登革热感染的疾病严重程度

13. 中新世早期远洋鲨鱼的灭绝

14. SARS-CoV-2非RBD刺突表位的普遍,保护和收敛IgG识别

封面:涵盖人类转录预启动复合物(PIC);粉红色和红色)和多亚基介体复合物(橙色,左)组装成DNA启动子区域(橙色线圈,中心)上的超复合物(76个多肽,分子量:4.1兆道尔顿)以启动基因转录。介体结合PIC中的RNA聚合酶II(紫色)并刺激其C-末端结构域的磷酸化(以白色突出显示),这是转录起始中的关键事件。

 

1. 人介体和介体结合的预起始复合物的结构【徐彦辉@复旦大学】

Structures of the human Mediator and Mediator-bound preinitiation complex

1.3兆道尔顿转录因子IID(TFIID)是几乎所有基因上的预起始复合物(PIC)组装和RNA聚合酶II(Pol II)介导的转录起始所必需的。26个亚基的介体刺激转录和细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)介导的Pol II C末端结构域(CTD)的磷酸化。我们确定了人类介体在尾部模块中的结构-延伸(以接近原子的分辨率)和尾部弯曲构象-以及基于TFIID的PIC介体(76个多肽,〜4.1兆道尔顿)在四个不同构象中的结构。PIC-Mediator组装诱导Mediator的协调重组(头倾斜和中下),并创建头-中三明治,稳定两个CTD片段并将CTD带到CDK7进行磷酸化;这表明CTD门控机制有利于磷酸化。基于TFIID的PIC体系结构可调节介体的组织和TFIIH的稳定性,从而强调了TFIID在协调PIC介体组装中的重要性。

 2. 肽-MHC上的典型T细胞受体对接对于T细胞信号传导至关重要

Canonical T cell receptor docking on peptide–MHC is essential for T cell signaling

肽-主要组织相容性复合物(pMHC)的T细胞受体(TCR)识别的特征是高度保守的对接极性。这种极性是由识别还是信号约束驱动尚不清楚。使用“反向对接”来自小鼠CD8+T navie细胞的TCRβ-variable(TRBV)识别H-2Db-NP366表位,我们证明它们不能支持T细胞活化和体内募集是反向对接极性的直接结果,而不是TCR-pMHCI结合或聚集特征。规范的TCR-pMHCI对接可将CD8/Lck最佳地定位到CD3复合体,这可通过反向TCR-pMHCI极性来防止。通过将Lck与CD8分离来规避规范对接的要求。因此,共识TCR-pMHC对接拓扑结构是由T细胞信号传导约束所强制要求的。

 3. 有义密码子重新分配使病毒抗性和编码聚合物合成

Sense codon reassignment enables viral resistance and encoded polymer synthesis

人们普遍认为,去除细胞转移RNA(tRNA)-使其同源密码子不可读-可能会为病毒感染创建遗传防火墙,并实现有义密码子重新分配。但是,不可能检验这些假设。在这项工作中,在大肠杆菌的同义密码子压缩和实验室进化之后,我们删除了tRNA和释放因子1,其通常解码两个有义密码子和终止密码子;得到的细胞不能读取规范的遗传密码,并且完全抵抗病毒混合物。我们重新分配了这些密码子,以便能够有效合成包含三个不同非规范氨基酸的蛋白质。值得注意的是,我们证明了细胞的重编程的容易性,用于编码各种非规范杂聚物和大环化合物的翻译。

 9. 广泛的多效性和等位基因异质性介导IRX3和IRX5的代谢作用

Extensive pleiotropism and allelic heterogeneity mediate metabolic effects of IRX3 and IRX5

尽管编码变体通常在多个组织中具有多效性作用,但非编码变体被认为通过特定组织和基因表达的时间调节来介导其表型作用。在这里,我们调查了FTO基因内与肥胖风险密切相关的基因组区域的遗传和功能结构。我们显示,一个共同的单倍型上的多个变体修改了从兆碱基距离靶向IRX3和IRX5的几种增强子的调控特性。我们证明这些增强子影响多种组织,包括脂肪和大脑中的基因表达,并在有限的时间窗口内赋予调节作用。我们的数据表明,疾病相关基因座的遗传结构可能涉及广泛的多效性,等位基因异质性,跨组织共享的等位基因效应以及时间限制的效应。

本期链接:https://science.sciencemag.org/content/372/6546

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